申し訳ございませんが、カート内にチェックボックスを設置することはできません。
※カートページを含め、SSL対応ページはセキュリティの面からHTML編集ができない仕様となっております。
代替案ではございますが、【 顧客表示項目設定 】で「フリー項目」を設定することでご希望に近い運用を行っていただけるかと存じます。
「フリー項目」はチェックボックスとはなりませんが、購入者様に記入していただく「記入欄」を任意で設置いただけます。
たとえば、項目名を 「プライバシーポリシーに同意する（はい、いいえ、でお答えください）」 としていただき、［必須項目にする］を選択すると、こちらの項目に何かを入力をしなければ購入できないようになります。
よろしければ、上記の設定でご希望の運用が可能かどうかご検討いただけますと幸いです。
▽マニュアル - 顧客表示項目設定
https://shop-pro.jp/manual/custdisp_edt